原来牛奶中所含的糖都是乳糖，乳糖在胃肠道里必需经过一种特殊酶的作用才能被消化成葡萄糖和半乳糖，这种酶叫做乳糖酶。一般的孩子胃里有很丰富的乳糖酶，消化乳糖毫不费力。但是有些孩子胃里却缺少乳糖酶，因此没有消化乳糖的能力。当这些孩子喝了牛奶后，牛奶中的乳糖在肠道中一面吸收大量的水分，一面被肠道细菌分解发酵，产生大量的二氧化碳气体，导致肠道鼓胀，促进肠道蠕动，加强肠道收缩，因而出现肠鸣和腹泻，这叫做"乳糖不耐症”。这种孩子最好不要再喝牛奶，改用其他奶制品，酸奶或在牛奶中加一些乳糖酶。这样就可以避免由于"乳糖不耐症”所造成的腹胀、腹泻等。

有的孩子喝牛奶后腹泻是对牛奶中蛋白质过敏所致。在正常情况下，都是将蛋白质消化分解后再吸收，这就消除了动物的种属特异性。而那些对牛奶蛋白质过敏的孩子，是因为肠道粘膜屏障发育不完善、牛奶中一些低分子蛋白质就极容易吸入血，牛奶蛋白质就成为一种异性蛋白，人体对异性蛋白会产生排斥反应，表现为过敏现象。肠道因过敏而水肿，肠腔里水分大量增加，肠道增加蠕动来加强排泄过敏原，从而造成肠鸣、腹泻。因此，对牛奶过敏的孩子，应尽量用母乳喂养，没有人乳时，可以选用无牛奶的其他代乳品。