HBV隐匿性感染的可能机制有：

(1)HBV-DNA序列的变异或整合可能改变了HBV蛋白的表达，导致HBsAg无法检测出以及可能的宿主免疫应答的逃逸。

(2)外周血单核细胞(PBMC)感染HBV，肝外HBV复制使HBV感染持续存在。

(3)血中含HBV-DNA的免疫复合物持续存在可产生HBsAg阴性的病毒血症。

(4)合并其他亲肝病毒感染干扰或抑制HBV的复制。