肝癌伴腹水、黄疸、远处转移等情况时，称为晚期肝癌。

对肝癌伴腹水者，可使用中药或西药利尿剂治疗，腹水消退后，根据肝内肿瘤情况，仍可按上法治疗。

肝癌伴黄疸者，若为肝门区肿块压迫所致阻塞性黄疸，可采用局部放射治疗，或局部瘤内注射、介入治疗，内支架或外引流治疗；若为非黄疸，可用中医药治疗、保肝治疗。

晚期肝癌发生转移，可采用放射治疗、药物化疗、生物治疗或放射性核素治疗。

对门静脉、肝静脉、下腔静脉有癌栓者，可尝试用肝动脉灌注化疗法，一般不采用肝动脉栓塞，可用生物治疗或中医药治疗。