脂肪肝的发病机制至今尚未完全明确，可能存在下列几种因素。

(1)脂肪代谢异常。游离脂肪酸大量输送入肝，在肝脏内合成并储存三酰甘油增加。

(2)激素影响。雌激素、生长激素、皮质醇、胰高血糖素、胰岛素及胰岛素样生长因子等，可能通过改变能量代谢途径而诱发脂肪肝形成。

(3)环境因素。饮食、营养状况、食物污染及肝炎病毒感染等因素与脂肪肝以及并发脂肪性肝炎、肝硬化有关，

(4)遗传因素。无论是酒精性还是非酒精性脂肪肝的发生，都存在一定的遗传因素。

(5)免疫反应。新抗原表达、淋巴细胞表型改变、体液抗体及细胞因子出现与免疫反应有关。

(6)游离脂肪酸的作用。肝脏脂肪氧化磷酸化和脂肪酸氧化受阻，对脂肪性肝病的形成起着关键作用。

(7)缺氧和肝微循环障碍。长期严重的脂肪肝引起肝内代谢严重紊乱，导致肝细胞缺血坏死，从而诱发肝纤维化、肝硬化。