熊去氧胆酸(UDCA)是唯一经证明对本病有效的药物。目前认为熊去氧胆酸治疗原发性胆汁性肝硬化的机制主要包括三个方面：促进胆汁分泌（利胆）、抗肝细胞及胆管上皮细胞凋亡以及免疫调节作用。推荐剂量为每日每千克体重13~15mg，可分2~3次口服。多项临床试验均表明本药能显著改善患者的血液生化异常、延缓肝脏组织学恶性发展，但对于能否改善瘙痒等临床症状，尤其是能否延长患者的生存期及延缓对肝移植的需求尚有不同的观点。

由于熊去氧胆酸并不能根除原发性胆汁性肝硬化的病因，因此需要长期治疗（终身治疗或直到肝移植）。

对于熊去氧胆酸无效或疗效不明显者，应考虑剂量是否足够及诊断是否准确。对于原发性胆汁性肝硬化合并自身免疫性肝炎者，可适当加用激素，如泼尼松（或泼尼龙）每日10一15mg。