脂肪肝实验室检查的异常，视病因和脂肪侵蚀的严重程度、范围而定。单纯轻度脂肪肝的实验室检查可无明显异常，中、重度脂肪肝由于脂肪囊肿的破裂及肥大从而压迫胆管，可以导致血清氨基转移酶升高，AST高于ALT，血清胆红素轻度或中度升高。若脂肪沉积在肝小叶中心带，以致影响肝对色素的代谢，可出现酚四溴酞钠(BSP)和靛青绿试验(ICG)排泄异常。此外，血清脂蛋白在质量和数量上也可发生异常，表现为a1-球蛋白、a2一球蛋白、β-球蛋白比例升高，白蛋白、球蛋白比例失调，血清碱性磷酸酶水平可能升高。然而根据肝活检证实的脂肪肝仅有20%~30%的患者有上述一项或一项以上指标异常，因而实验室检查并不作为准确诊断脂肪肝的手段。