绝大多数慢性脂肪肝患者预后良好，如能早期诊治，可以阻止脂肪肝的进一步恶化，甚至使其逆转。肥胖、糖尿病、高脂血症等引起的脂肪肝，多数起病隐匿、病程相对较长，但即使已发展到脂肪性肝炎和肝纤维化，如能有效控制体重和维持血脂、血糖处于正常水平，肝脏病变仍有好转乃至完全消退的可能。

病毒性肝炎合并脂肪肝时，其预后基本上取决于肝炎的治疗状况，因为此时主要的致病因素是肝炎而不是脂肪化。

酒精性脂肪肝若能坚持戒酒则预后良好。但如果继续饮酒，可经肝纤维化或酒精性肝炎最终发展为肝硬化。